MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 92402

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010546	TCT	2	6	23	28	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034918
2	NC_010546	AAT	2	6	136	141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034918
3	NC_010546	TCC	2	6	253	258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034918
4	NC_010546	GTT	2	6	285	290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034918
5	NC_010546	TCC	2	6	308	313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034918
6	NC_010546	TCT	2	6	368	373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034918
7	NC_010546	CCA	2	6	458	463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034918
8	NC_010546	TCA	3	9	642	650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034918
9	NC_010546	AAT	2	6	747	752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034918
10	NC_010546	A	6	6	769	774	100 %	0 %	0 %	0 %	172034918
11	NC_010546	TTC	2	6	784	789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034918
12	NC_010546	AAT	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034918
13	NC_010546	TCC	2	6	809	814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034918
14	NC_010546	AAAG	2	8	815	822	75 %	0 %	25 %	0 %	172034918
15	NC_010546	CGA	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034918
16	NC_010546	GCT	2	6	934	939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
17	NC_010546	AGA	2	6	999	1004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034919
18	NC_010546	TTTG	2	8	1025	1032	0 %	75 %	25 %	0 %	172034919
19	NC_010546	A	6	6	1042	1047	100 %	0 %	0 %	0 %	172034919
20	NC_010546	TCT	2	6	1048	1053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034919
21	NC_010546	AAT	2	6	1221	1226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034919
22	NC_010546	C	6	6	1263	1268	0 %	0 %	0 %	100 %	172034919
23	NC_010546	GTC	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
24	NC_010546	TGA	2	6	1351	1356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034919
25	NC_010546	GCA	2	6	1384	1389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034919
26	NC_010546	TC	3	6	1412	1417	0 %	50 %	0 %	50 %	172034919
27	NC_010546	CA	3	6	1460	1465	50 %	0 %	0 %	50 %	172034919
28	NC_010546	CAAAA	2	10	1508	1517	80 %	0 %	0 %	20 %	172034919
29	NC_010546	CTG	2	6	1599	1604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
30	NC_010546	AAC	2	6	1616	1621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034919
31	NC_010546	TCC	2	6	1635	1640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034919
32	NC_010546	GTT	2	6	1820	1825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034919
33	NC_010546	GTC	2	6	1827	1832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
34	NC_010546	GCT	2	6	1876	1881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
35	NC_010546	TCGC	2	8	1892	1899	0 %	25 %	25 %	50 %	172034919
36	NC_010546	ATC	2	6	1900	1905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034919
37	NC_010546	CTG	2	6	2076	2081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034920
38	NC_010546	AG	3	6	2086	2091	50 %	0 %	50 %	0 %	172034920
39	NC_010546	CAA	2	6	2146	2151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034920
40	NC_010546	TCC	2	6	2222	2227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034920
41	NC_010546	GTTT	2	8	2493	2500	0 %	75 %	25 %	0 %	172034921
42	NC_010546	T	6	6	2510	2515	0 %	100 %	0 %	0 %	172034921
43	NC_010546	TAAA	2	8	2607	2614	75 %	25 %	0 %	0 %	172034921
44	NC_010546	TTA	2	6	2789	2794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034921
45	NC_010546	TAA	2	6	2809	2814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
46	NC_010546	TAA	2	6	2844	2849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
47	NC_010546	CCA	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
48	NC_010546	ATG	2	6	2891	2896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034921
49	NC_010546	CTA	2	6	2910	2915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
50	NC_010546	TAG	2	6	2946	2951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034921
51	NC_010546	GAA	2	6	2971	2976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034921
52	NC_010546	ATA	2	6	2990	2995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
53	NC_010546	ATT	2	6	3025	3030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034921
54	NC_010546	CCA	2	6	3126	3131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
55	NC_010546	CCATA	2	10	3213	3222	40 %	20 %	0 %	40 %	172034921
56	NC_010546	ATT	2	6	3301	3306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034921
57	NC_010546	ACCG	2	8	3325	3332	25 %	0 %	25 %	50 %	172034921
58	NC_010546	AATT	2	8	3340	3347	50 %	50 %	0 %	0 %	172034921
59	NC_010546	CCA	2	6	3396	3401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
60	NC_010546	GCT	2	6	3437	3442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034921
61	NC_010546	C	6	6	3646	3651	0 %	0 %	0 %	100 %	172034921
62	NC_010546	ACTC	2	8	3763	3770	25 %	25 %	0 %	50 %	172034921
63	NC_010546	GC	3	6	3792	3797	0 %	0 %	50 %	50 %	172034921
64	NC_010546	AGC	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034921
65	NC_010546	AAT	2	6	4012	4017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
66	NC_010546	AACGA	2	10	4066	4075	60 %	0 %	20 %	20 %	172034921
67	NC_010546	AATG	2	8	4078	4085	50 %	25 %	25 %	0 %	172034921
68	NC_010546	TAA	2	6	4114	4119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
69	NC_010546	CA	3	6	4125	4130	50 %	0 %	0 %	50 %	172034921
70	NC_010546	CTA	2	6	4152	4157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
71	NC_010546	GCA	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034921
72	NC_010546	AATA	2	8	4178	4185	75 %	25 %	0 %	0 %	172034921
73	NC_010546	AAT	3	9	4255	4263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
74	NC_010546	A	6	6	4272	4277	100 %	0 %	0 %	0 %	172034921
75	NC_010546	GTT	2	6	4351	4356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034921
76	NC_010546	ATC	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
77	NC_010546	CAC	2	6	4402	4407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
78	NC_010546	C	6	6	4429	4434	0 %	0 %	0 %	100 %	172034921
79	NC_010546	ATC	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
80	NC_010546	TCA	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
81	NC_010546	AAC	2	6	4550	4555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034921
82	NC_010546	GA	3	6	4588	4593	50 %	0 %	50 %	0 %	172034921
83	NC_010546	AGC	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034921
84	NC_010546	CTG	2	6	4662	4667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034921
85	NC_010546	ATC	2	6	4748	4753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
86	NC_010546	ACC	2	6	4757	4762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
87	NC_010546	CTTTAA	2	12	4854	4865	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	172034921
88	NC_010546	TAA	2	6	4918	4923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
89	NC_010546	GCC	2	6	4930	4935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172034921
90	NC_010546	GCT	2	6	4979	4984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034921
91	NC_010546	GA	3	6	4999	5004	50 %	0 %	50 %	0 %	172034921
92	NC_010546	GA	3	6	5099	5104	50 %	0 %	50 %	0 %	172034921
93	NC_010546	GA	3	6	5149	5154	50 %	0 %	50 %	0 %	172034921
94	NC_010546	GA	3	6	5202	5207	50 %	0 %	50 %	0 %	172034921
95	NC_010546	TGT	2	6	5261	5266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034921
96	NC_010546	TAC	2	6	5320	5325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
97	NC_010546	GAG	2	6	5351	5356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034921
98	NC_010546	TCT	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034921
99	NC_010546	T	6	6	5585	5590	0 %	100 %	0 %	0 %	172034921
100	NC_010546	AAG	2	6	5602	5607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034921
101	NC_010546	CCA	2	6	5830	5835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034922
102	NC_010546	CAC	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034922
103	NC_010546	AGC	2	6	5889	5894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034922
104	NC_010546	TCA	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034922
105	NC_010546	CTG	2	6	5927	5932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034922
106	NC_010546	TCA	2	6	5996	6001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034922
107	NC_010546	CCG	2	6	6026	6031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172034922
108	NC_010546	GTT	2	6	6191	6196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034922
109	NC_010546	ATA	2	6	6271	6276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034922
110	NC_010546	ACC	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034922
111	NC_010546	TCA	2	6	6410	6415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034922
112	NC_010546	TCA	3	9	6428	6436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034922
113	NC_010546	A	6	6	6569	6574	100 %	0 %	0 %	0 %	172034923
114	NC_010546	GAG	2	6	6597	6602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034923
115	NC_010546	CTT	2	6	6666	6671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034923
116	NC_010546	TAA	2	6	6697	6702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034923
117	NC_010546	TGA	3	9	6716	6724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034923
118	NC_010546	AT	3	6	6779	6784	50 %	50 %	0 %	0 %	172034923
119	NC_010546	GAT	2	6	6810	6815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034923
120	NC_010546	TGT	2	6	6926	6931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034923
121	NC_010546	ACC	2	6	6952	6957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034923
122	NC_010546	ATA	2	6	6967	6972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034923
123	NC_010546	ATG	2	6	7074	7079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034923
124	NC_010546	T	8	8	7100	7107	0 %	100 %	0 %	0 %	172034923
125	NC_010546	CAA	2	6	7134	7139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034923
126	NC_010546	GAT	2	6	7141	7146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034923
127	NC_010546	TAAAT	2	10	7147	7156	60 %	40 %	0 %	0 %	172034923
128	NC_010546	T	6	6	7171	7176	0 %	100 %	0 %	0 %	172034923
129	NC_010546	TTGGG	2	10	7202	7211	0 %	40 %	60 %	0 %	172034923
130	NC_010546	AAT	2	6	7219	7224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034923
131	NC_010546	TC	3	6	7394	7399	0 %	50 %	0 %	50 %	172034924
132	NC_010546	CAA	2	6	7422	7427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034924
133	NC_010546	CCT	2	6	7452	7457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034924
134	NC_010546	ATC	2	6	7501	7506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034924
135	NC_010546	ATT	2	6	7528	7533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034924
136	NC_010546	CAAA	2	8	7569	7576	75 %	0 %	0 %	25 %	172034924
137	NC_010546	ATC	2	6	7600	7605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034924
138	NC_010546	ATT	2	6	7616	7621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034924
139	NC_010546	TGC	2	6	7877	7882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034925
140	NC_010546	TAA	2	6	7907	7912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034925
141	NC_010546	ATT	2	6	7931	7936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034925
142	NC_010546	AGA	2	6	8004	8009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034925
143	NC_010546	TC	3	6	8031	8036	0 %	50 %	0 %	50 %	172034925
144	NC_010546	TGT	2	6	8064	8069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034925
145	NC_010546	CAA	2	6	8104	8109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034925
146	NC_010546	TGAT	2	8	8119	8126	25 %	50 %	25 %	0 %	172034925
147	NC_010546	GTT	3	9	8130	8138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034926
148	NC_010546	TAGTCA	2	12	8141	8152	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	172034926
149	NC_010546	AAT	2	6	8174	8179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034926
150	NC_010546	GTT	2	6	8193	8198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034926
151	NC_010546	TCG	2	6	8200	8205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034926
152	NC_010546	GCT	2	6	8225	8230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034926
153	NC_010546	ACT	2	6	8234	8239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034926
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155	NC_010546	AATT	2	8	8281	8288	50 %	50 %	0 %	0 %	172034926
156	NC_010546	GTC	2	6	8290	8295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034926
157	NC_010546	CTAA	2	8	8452	8459	50 %	25 %	0 %	25 %	172034927
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160	NC_010546	T	6	6	8750	8755	0 %	100 %	0 %	0 %	172034927
161	NC_010546	A	6	6	8843	8848	100 %	0 %	0 %	0 %	172034928
162	NC_010546	GTT	2	6	8896	8901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034928
163	NC_010546	T	6	6	9001	9006	0 %	100 %	0 %	0 %	172034928
164	NC_010546	CGG	2	6	9019	9024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034928
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166	NC_010546	ATG	2	6	9137	9142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034928
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170	NC_010546	TAGT	2	8	9380	9387	25 %	50 %	25 %	0 %	172034929
171	NC_010546	TTG	2	6	9398	9403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034929
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174	NC_010546	GTT	2	6	9483	9488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034929
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179	NC_010546	CAAT	2	8	9864	9871	50 %	25 %	0 %	25 %	172034929
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232	NC_010546	TTC	2	6	12808	12813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034933
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246	NC_010546	ATCGAA	2	12	13518	13529	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	172034933
247	NC_010546	GGA	2	6	13535	13540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034933
248	NC_010546	GGATTA	2	12	13544	13555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034933
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250	NC_010546	TAA	2	6	13714	13719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034934
251	NC_010546	TAA	2	6	13729	13734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034934
252	NC_010546	ATC	2	6	13768	13773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034934
253	NC_010546	CAT	2	6	13785	13790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034934
254	NC_010546	ATA	2	6	13824	13829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034934
255	NC_010546	AGCC	2	8	14004	14011	25 %	0 %	25 %	50 %	172034934
256	NC_010546	GATGAA	2	12	14022	14033	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	172034934
257	NC_010546	ACT	2	6	14053	14058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034934
258	NC_010546	AGAAA	2	10	14090	14099	80 %	0 %	20 %	0 %	172034934
259	NC_010546	AAG	2	6	14130	14135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034934
260	NC_010546	TCGGCA	2	12	14148	14159	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	172034934
261	NC_010546	ATA	2	6	14184	14189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034934
262	NC_010546	C	6	6	14213	14218	0 %	0 %	0 %	100 %	172034934
263	NC_010546	AAGA	2	8	14302	14309	75 %	0 %	25 %	0 %	172034934
264	NC_010546	GGGAAT	2	12	14311	14322	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	172034934
265	NC_010546	AAT	2	6	14367	14372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034934
266	NC_010546	TTTC	2	8	14460	14467	0 %	75 %	0 %	25 %	172034934
267	NC_010546	CAA	2	6	14493	14498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034934
268	NC_010546	GTG	2	6	14501	14506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034934
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272	NC_010546	T	8	8	14687	14694	0 %	100 %	0 %	0 %	172034934
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274	NC_010546	TTC	2	6	14818	14823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034934
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282	NC_010546	C	7	7	15314	15320	0 %	0 %	0 %	100 %	172034935
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